Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Cldn8Q9Z260 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Cldn8Q9Z260 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms