Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1S5

Sept3, Neuronal-specific septin-3, mousemouse

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Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept3Q9Z1S5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Sept3Q9Z1S5 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sept3Q9Z1S5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms