Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S7

Cldn9, Claudin-9, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn9Q9Z0S7 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Cldn9Q9Z0S7 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Cldn9Q9Z0S7 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Cldn9Q9Z0S7 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Cldn9Q9Z0S7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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Cldn9Q9Z0S7 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Cldn9Q9Z0S7 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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