Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Tmed2Q9R0Q3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms