Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 AC132446.1-201ENSMUST00000222655 226 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Gpc6Q9R087 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms