Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
AmfrQ9R049 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 189.5 ms