Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ49

Ubxn8, UBX domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn8Q9QZ49 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ubxn8Q9QZ49 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms