Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Phtf1Q9QZ09 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Phtf1Q9QZ09 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms