Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Kcnip3Q9QXT8 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Kcnip3Q9QXT8 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms