Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

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Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
ChmQ9QXG2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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