Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Limd1Q9QXD8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 CT009764.1-201ENSMUST00000222260 483 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Limd1Q9QXD8 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms