Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lmbr1-201ENSMUST00000055195 4926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Lmbr1-202ENSMUST00000179191 4836 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trim44Q9QXA7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms