Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm13408-201ENSMUST00000119822 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm13935-201ENSMUST00000121859 798 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm17135-201ENSMUST00000167009 564 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Krtap20-2-201ENSMUST00000169954 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm16397-201ENSMUST00000122201 494 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Trpc5Q9QX29 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms