Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Csnk1eQ9JMK2 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms