Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rabgef1Q9JM13 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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