Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
FancaQ9JL70 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
FancaQ9JL70 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms