Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER71

Rhoj, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhojQ9ER71 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RhojQ9ER71 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms