Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
SgshQ9EQ08 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms