Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR1

Xrn2, 5'-3' exoribonuclease 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrn2Q9DBR1 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Elovl1-203ENSMUST00000102673 1248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm28287-201ENSMUST00000186612 546 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm12566-201ENSMUST00000121479 359 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm45437-201ENSMUST00000209998 448 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Xrn2Q9DBR1 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms