Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SrpraQ9DBG7 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms