Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Rsph3bQ9DA80 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rsph3bQ9DA80 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms