Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc89Q9DA73 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc89Q9DA73 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms