Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Cldn34b2Q9D9N2 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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