Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Fip1l1Q9D824 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Fip1l1Q9D824 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms