Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slx4ipQ9D7Y9 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slx4ipQ9D7Y9 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Slx4ipQ9D7Y9 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Slx4ipQ9D7Y9 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Slx4ipQ9D7Y9 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms