Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Klhl40Q9D783 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Klhl40Q9D783 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms