Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm10787-201ENSMUST00000099552 1548 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
MsraQ9D6Y7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm8546-201ENSMUST00000178288 1264 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
MsraQ9D6Y7 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms