Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

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Length 360 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Mrap-201ENSMUST00000038197 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
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Borcs6Q9D6W8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Borcs6Q9D6W8 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Borcs6Q9D6W8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Borcs6Q9D6W8 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Borcs6Q9D6W8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms