Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Krt34Q9D646 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms