Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccdc7Q9D541 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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