Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gcc1Q9D4H2 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gcc1Q9D4H2 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms