Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Q9D2Q3 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms