Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mrpl53Q9D1H8 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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