Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZX0

Elp3, Elongator complex protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elp3Q9CZX0 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Elp3Q9CZX0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm44207-201ENSMUST00000204568 1424 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Elp3Q9CZX0 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms