Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZH8

Ccdc77, Coiled-coil domain-containing protein 77, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc77Q9CZH8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Ccdc77Q9CZH8 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc77Q9CZH8 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.3 ms