Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Q9CYI0 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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