Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Utp23Q9CX11 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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