Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Snx10Q9CWT3 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Snx10Q9CWT3 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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