Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Pfdn1Q9CWM4 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Kalrn-207ENSMUST00000114960 6452 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Pfdn1Q9CWM4 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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