Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snw1Q9CSN1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms