Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Ykt6Q9CQW1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Ykt6Q9CQW1 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms