Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PompQ9CQT5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PompQ9CQT5 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms