Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQR7

Psenen, Gamma-secretase subunit PEN-2, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PsenenQ9CQR7 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
PsenenQ9CQR7 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
PsenenQ9CQR7 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms