Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF0

Mrpl11, 39S ribosomal protein L11, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl11Q9CQF0 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Mrpl11Q9CQF0 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms