Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Fosb-203ENSMUST00000207716 3546 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gabbr1-203ENSMUST00000172792 4036 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Rab5aQ9CQD1 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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Rab5aQ9CQD1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Rab5aQ9CQD1 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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