Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
1700029P11RikQ9CQ68 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms