Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Atg3Q9CPX6 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Atg3Q9CPX6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms