Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ssxb1Q9CPU1 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms