Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nsmce3Q9CPR8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms