Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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Ms4a4dQ99N05 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Ms4a4dQ99N05 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Ms4a4dQ99N05 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Ms4a4dQ99N05 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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